Mit dem Firmware-Update 1.2.4 für den FPGA-basierten Analogue 3D beseitigt Analogue ein großes Ärgernis für Nutzer von N64-Flash-Carts: Änderungen im ROM-Header werden nun korrekt erkannt, sodass jedes Spiel auf einem einzelnen Modul als eigener Eintrag in der Bibliothek erscheint. Die Funktion ,,Advanced Library Detection" stellt sicher, dass spielbezogene Spielstände und Einstellungen erhalten bleiben – darunter etwa Daten aus dem Virtual Controller Pak und individuelle Controller-Konfigurationen. Weitere Anpassungen am Betriebssystem, etwa ein vom eingesetzten Modul abhängiger ,,Ready"-Hinweis, sollen den Startvorgang zusätzlich vereinfachen.